故事設定在《金庸群俠傳》遊戲結束後的一百年，玩家扮演的將是一個名不見經傳的小人物（3.0版的名字可以由玩家自己設定），在聽過百年前名滿江湖的大小蝦米的事跡後，就一直心生景仰。終於有一天這個小人物來到了洛陽城，在參觀小蝦米大俠的英雄雕像時，主角會認識一位同樣崇拜著小蝦米事跡的年輕人，他就是逍遙谷掌門“無瑕子”的大弟子“谷月軒”，從此主角便開始了他的江湖之路，一位未來的新英雄，也在此刻開始誕生。