《東京Chronos》講述了16歲主角櫻井京介（Kyosuke Sakurai）發現自己身處於特殊世界裡的故事：這裡是時間靜止的東京涉谷，裡面空無一人。這個故事涉及“8位與當前世界現實分離的童年玩伴，受困於空無一人的涉谷之中，這裡沒有其他靈魂的存在。”